原标题：蛋白质是什么？（中） 蛋白质组：蛋白质的4+级结构（上） 蛋白质的结构 这种持续连接的多个氨基酸的组合就是一个多肽的序列，我们把它叫做蛋白质的一级结构，空间表示为一条线；而蛋白质的二级结构就是当我们把线进行缠绕弯曲、摆出的造型。这种造型是通过化学作用力来来实现和维持的。如图，因为作用力的牵引，有的氨基酸就会被拉上去，结构上看就会弯曲起来。 这是一种最简单的叫弯曲的结构，我们把它叫做阿尔法螺旋；其他的二级结构包括也包括一种折叠型构想，如图。大家想象一把剪刀，我们把剪刀收回的时候，剪刀的尖尖就连到一起去了。我们把它叫做贝塔折叠。而除了这两种却常见的结构之外，我们还有比如说贝塔转角、无规卷曲等等。 蛋白质的三级结构是多个二级结构的拓扑。可以理解成二级结构在空间层面的叠加。如图。而形成一个蛋白往往是有不只一个多肽组成的，若干存在三级结构的多肽绞合在一起就成了蛋白质的四级结构。 联系到之前举的例子，这条线就是我们今天说的一级结构；当我们把这条线卷曲盘旋再跟其它的线绕到一起，就能形成一个四级结构。 按照之前概念延伸的话，我们可以说蛋白质组是蛋白质的五级结构了；但是因为这个概念还没有被官方界…read more
年度归档： 2021年
Thinking wisely before thinking big: A Talking to ECRs interview
One of my volunteer jobs in HUPO is to interview scholars and broadcast their thinkings to the community. This is a recorded 1v1 interview with Dr Ruedi Aebersold. The content was originically released by HUPO official Wechat account: HUPO-Wechat. Permission to reproduce the article was granted. Original Title: HUPO ReCONNECT 2021 interview: Ruedi Aeberold– Xiao Liang Interviewer & IntervieweeTo offer ECRs a better opportunity to have deep communication with established experts in …read more
The road of science is never lonely: A Talking to ECRs interview
One of my volunteer jobs in HUPO is to interview scholars and broadcast their thinkings to the community. This is a recorded 1v1 interview with Dr Brian Searle. The content was originically released by HUPO official Wechat account: HUPO-Wechat. Permission to reproduce the article was granted. Original Title: HUPO ReCONNECT 2021 interview: Brian Searle – Xiao Liang To offer ECRs a better opportunity to have deep communications with established experts in the field of proteomics, HUPO WeChat Offic…read more
发表在CNS(子刊)的国内蛋白质组论文汇总202010-202110
English title: Summary of CNS-level publications in China that specify on proteomics in the past year 查找方式 Nature Cell Science及其对应的重点子刊网站 搜索范围为一年内（2020.10-2021.10） 搜索关键词为Proteomics 搜索类型为articles and letters 对于单位在海外的华人学者论文 (eg. articles from Hui Zhang, Rong Fan, etc.) 做剔除 仅用proteomics做验证而非关键表征手段的论文做剔除 查找结果 Quantitative mapping of the cellular small RNA landscape with AQRNA-seqNature BiotechBo Cao, MIT & Qu Fu Normal Universityhttps://www.nature.com/articles/s41587-021-00874-y Eosinophil extra…read more
蛋白质组：蛋白质的4+级结构（上）
原标题：蛋白质是什么？（上） 引言 蛋白质和蛋白质组的科学概念，虽然简单却难以说清。我尝试对蛋白质学科进行科普。我通过类比来描述从氨基酸到多肽再到蛋白质的分子学和结构学定义；再将蛋白质组拟定为蛋白质的4+级结构，来阐释蛋白质间相互作用的特性。 （如下内容更改于20211206为西湖欧米做的培训录屏。文字经音频转换并人工核对修改；图片内容来自课件；部分素材收集于网络并已标明出处） 蛋白质为什么叫蛋白质？ 大家有没有好奇过：蛋白质这个名词是怎么来的？不像核苷酸或氨基酸——是化学物质的直接翻译；也不像基因——从英文gene直接音译过来，这个名字听起来就有点怪怪的。 从历史来看，在18世纪的时候，有个科学家用酸处理了一系列物质，包括蛋清、血液、纤维素和小麦面筋等等，发现都有一些絮状物和凝结体出现。当事人认为这个东西它可能是存在于所有的有活性的物质中。到了19世纪，另一个科学家对这些这些沉淀物进行了分析，发现他们的实验公式都是一样的。他的一个合作者用了proteios这个希腊名词，作为protos “最原初的、最重要的”的变体，以体现这个东西因为在生命活性的物质中都存在、所以非常重要、可能是是生…read more
liangxiao.pro: An academia profile and beyond
Hi, I am Xiao. Welcome to the very first blog of my academia profile. The content below involves a list of descriptions of this website. I started the website on 20211121, with the idea of integrating my academic events, including CV, featured publications, recorded talks, and public activities. A highlight is in Blog, where I in line with my research, summarize my reviews and ideas. Science propagation might be included in the future. Because the formal career started with my Ph.D. training sin…read more
