来自赛默飞的Philip M. Remes和华盛顿大学的MacCoss团队日前于Journal of Proteome Research (IF≈5)公开了他们基于赛默飞最新质谱：Stellar mass spectrometer的最新技术工作，介绍了它实现高效靶向蛋白质组学的方式。论文标题：Hybrid Quadrupole Mass Filter–Radial Ejection Linear Ion Trap and Intelligent Data Acquisition Enable Highly Multiplex Targeted Proteomics；论文链接：https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.4c00599 。
笔者曾经介绍过Stellar MS（见博客链接：http://www.liangxiao.pro/2024/07/27/stellar-ms/ ； 或公众号链接：Stellar MS）；先前的工作由Mann组与Remes合作率先完成并公开，着重介绍其临床实验室的表现及基于参考标准肽进行的绝对定量能力；而本篇论文则由靶向大牛MacCoss操刀，对具体硬件和新设软件的性能进行了评估，干货十足；并且本篇的大量数据都是基于与Altis（上一代赛默飞靶向质谱仪）的对比，因此更具有靶向组学的代表性。
文中着重介绍的技术创新有两点：
硬件上，设计了混合四极杆质谱过滤器与径向弹射线性离子阱的结合。这种组合允许更高效的离子捕获和分析，从而提高了目标蛋白的检测能力（最低检出限、定量限等）。
软件上，设计了智能数据采集，通过动态的保留时间校正和离子采集时间设定（根据实时数据动态调整分析参数），从而最大化目标信号的捕获并减少背景噪音。
除此之外，Stellar MS也与PRM Conductor（一款帮助简化靶向多肽程序设计的软件，集成于Skyline和XCalibur）的适配度极高，可以帮助临床研究者更快速地完成靶向肽类地方法准备。
从结果上看， Stellar能实现最高100Hz的数据采集频率、以及相较Altis约10倍的最低定量限的提升。文中提到但没有进行的实验是有前景能实现每小时对约8000种多肽进行靶向分析。笔者注：包括赛默飞开发者在内，无论是研究意义上还是商业运作上，应该也不会有人进行这个论断的验证……
另注：赛默飞公开过一张关于Stellar靶向方法设计的技术海报，内容及其清晰，欢迎读者们赏读：https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/CMD/posters/po-0174-revolutionizing-translational-research-po0174-en.pdf
赛默飞的靶向质谱由于快、准、和（愿景上）越来越简单易操，可以实现复杂生物标志物的检测，在早期诊断和治疗监测上有优势，可能是其迈向临床实验室的步伐之一；当然它的对手，如Sciex的QTRAP系列，也实力颇丰。尤其是在上周三，Sciex官宣了其将于今年12月其在中国本土化生产SCIEX Triple Quad 6500+和QTRAP 6500+，而它们“靶向老玩家”的形象早已深入人心。戏谑地看，质谱的盘子，颇有合资车要跟进口车鏖战一番的意味了。
