English title: SEQUEST: Pioneer of the Year 1994 The original version of this article was published in the HUPO Official Wechat. Dr. Luyao Liu from Dalian Institute of Chemical Physics, CAS helped with the revision. I made several edits in this version. 原文标题:An Approach to Correlate Tandem Mass Spectral Data of Peptides with Amino Acid Sequences in a Protein Database;原文链接:https://pubs.acs.org/doi/10.1016/1044-0305(94)80016-2 一作:Jimmy Eng;通讯:John Yates. SEQUEST是由Jimmy Eng和John Yates领衔、在1994年完成设计的…read more
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蛋白质组:蛋白质的4+级结构(中)
原标题:蛋白质是什么?(中) 蛋白质组:蛋白质的4+级结构(上) 蛋白质的结构 这种持续连接的多个氨基酸的组合就是一个多肽的序列,我们把它叫做蛋白质的一级结构,空间表示为一条线;而蛋白质的二级结构就是当我们把线进行缠绕弯曲、摆出的造型。这种造型是通过化学作用力来来实现和维持的。如图,因为作用力的牵引,有的氨基酸就会被拉上去,结构上看就会弯曲起来。 这是一种最简单的叫弯曲的结构,我们把它叫做阿尔法螺旋;其他的二级结构包括也包括一种折叠型构想,如图。大家想象一把剪刀,我们把剪刀收回的时候,剪刀的尖尖就连到一起去了。我们把它叫做贝塔折叠。而除了这两种却常见的结构之外,我们还有比如说贝塔转角、无规卷曲等等。 蛋白质的三级结构是多个二级结构的拓扑。可以理解成二级结构在空间层面的叠加。如图。而形成一个蛋白往往是有不只一个多肽组成的,若干存在三级结构的多肽绞合在一起就成了蛋白质的四级结构。 联系到之前举的例子,这条线就是我们今天说的一级结构;当我们把这条线卷曲盘旋再跟其它的线绕到一起,就能形成一个四级结构。 按照之前概念延伸的话,我们可以说蛋白质组是蛋白质的五级结构了;但是因为这个概念还没有被官方界…read more